大约从人类经历第二次世界大战开始，世界各地开始出现了拥有超自然力量和异形外貌的人类，
不久之后，这些力量和特征被称为『异能力』，而拥有异能力的人则被称为『异能保持者』。

起初，人类对『异能保持者』们持有同情，但随着他们的数量增加，人们开始害怕、嫉妒和排斥他们的力量，
『异能保持者』们也开始使用自己的异能力与人类争斗，有些人是为了保护自己，有些人是为了炫耀自己的力量，
这样的恶性循环导致各地发生暴乱和犯罪，全球范围内的对立迅速加深。

人类和『异能保持者』的全球对立仿佛堤坝被打破，战乱在世界各地蔓延。
日本也不例外，人类和『异能保持者』之间的冲突爆发，政府功能暂时失效，发生了自卫军官未遂政变等动荡时期。

面对混乱的国内形势，日本政府作为一种新的维持治安机构，成立了一个特殊机动队，其中既有人类也有『异能保持者』。
被分配到新成立的特殊机动队第二课的队长，叫做柏木综人（かしわび あやと），他与队员们一起维护治安。

特殊机动队成立几年后，由于队员们的努力，犯罪率下降，国内治安保持平稳。
在日本恢复片刻平静之际，队员们属于特殊机动队，每天努力打击异能力犯罪。

然而，某个事件之后，由『异能保持者』组织所犯的犯罪增加，与此同时，人们的不安和对政府的指责声也迅速增长。
特殊机动队成员在处理事件时都怀有疑虑。
他们最终被卷入了涉及整个国家的巨大阴谋之中......

人类与『异能保持者』之间的冲突再次爆发，军队开始动用武力，而主人公们作为特殊机动队成员，则出动以控制冲突。
在各势力混乱的危机状态下，正义与痛苦交织的道路上，他们将看到什么......。